• 线性回归模型(OLS)3


    本系列文章基于 R 语言中 lm 函数的输出,介绍线性回归模型的例子和原理。

    本文是系列文章的第三篇。前两篇文章中:

    • 《线性回归模型(OLS)1》介绍了线性回归模型的定义以及基于普通最小二乘(OLS)求解回归系数的方法。
    • 《线性回归模型(OLS)2》介绍了线性回归模型常用的假设以及基于这些假设得到的一些结论。

    本文将介绍线性回归模型的模型评估。包括以下 4 个小节:

    1. 模型评估
    2. 示例:mtcars 数据集
    3. 模型推导
    4. 附录代码

    为求简洁,下文用《1》指代《线性回归模型(OLS)1》,而用《2》指代《线性回归模型(OLS)2》。

    以下内容为免费试读部分,完整文章可到公号“生信了”付费阅读

    1. 模型评估

    前文《1》介绍了线性回归模型用以下关系式来描述因变量 y n × 1 \mathbf{y}_{n \times 1} yn×1 与自变量 X n × ( p + 1 ) \mathbf{X}_{n \times (p+1)} Xn×(p+1) 之间的关系:

    y = X β + ϵ

    (3.1)y=Xβ+ϵ" role="presentation">(3.1)y=Xβ+ϵ
    y=Xβ+ϵ(3.1)

    其中 β \boldsymbol{\beta} β 是回归系数,而 ϵ \boldsymbol{\epsilon} ϵ 是误差项。注意 X \mathbf{X} X 一共包含 p p p 个自变量;其第一列都是 1,是对应着偏移项 β 0 \beta_0 β0 的值。OLS 下回归系数的最优估计值 β ^ \hat{\boldsymbol{\beta}} β^ 满足下式,即

    β ^ = arg ⁡ min ⁡ β ∥ y − X β ∥ 2

    (3.2)β^=argminβyXβ2" role="presentation" style="position: relative;">(3.2)β^=argminβyXβ2
    β^=argβminyXβ2(3.2)

    其解析解为:

    β ^ = ( X T X ) − 1 X T y

    (3.3)β^=(XTX)1XTy" role="presentation">(3.3)β^=(XTX)1XTy
    β^=(XTX)1XTy(3.3)

    在求得回归系数的估计值后,我们得到了一个“具体”的模型来描述因变量和自变量之间的关系。那接下来就是评估这个模型。在 R 语言 lm 函数的输出中,模型评估主要分为三个部分:

    • 拟合优度的计算,即检查模型对数据的拟合效果有多好。
    • 模型的 F F F 检验,即检查模型是否“显著”,或模型的自变量整体是否和因变量显著相关。
    • 回归系数的 t t t 检验,即检查每个自变量是否和因变量显著相关。
    1.1. 拟合优度的计算

    拟合优度(goodness of fit)是用来评估模型对观测值的拟合程度的概念;在线性回归模型中,可以用决定系数 R 2 R^2 R2(coefficient of determination)表示,其计算式如下:

    R 2 = E S S T S S = 1 − R S S T S S

    (3.4)R2=ESSTSS=1RSSTSS" role="presentation" style="position: relative;">(3.4)R2=ESSTSS=1RSSTSS
    R2=TSSESS=1TSSRSS(3.4)

    其中

    E S S = ∑ i = 1 n ( y ^ i − y ˉ ) 2 = ∥ y ^ − y ˉ ∥ 2

    (3.5)ESS=i=1n(y^iy¯)2=y^y¯2" role="presentation" style="position: relative;">(3.5)ESS=i=1n(y^iy¯)2=y^y¯2
    ESS=i=1n(y^iyˉ)2=y^yˉ2(3.5)

    R S S = ∑ i = 1 n ( y i − y ^ i ) 2 = ∥ y − y ^ ∥ 2

    (3.6)RSS=i=1n(yiy^i)2=yy^2" role="presentation" style="position: relative;">(3.6)RSS=i=1n(yiy^i)2=yy^2
    RSS=i=1n(yiy^i)2=yy^2(3.6)

    T S S = ∑ i = 1 n ( y i − y ˉ ) 2 = ∥ y − y ˉ ∥ 2

    (3.7)TSS=i=1n(yiy¯)2=yy¯2" role="presentation" style="position: relative;">(3.7)TSS=i=1n(yiy¯)2=yy¯2
    TSS=i=1n(yiyˉ)2=yyˉ2(3.7)

    上面的 y ˉ = 1 n ∑ i = 1 n y i \displaystyle \bar{y} = \frac{1}{n} \sum_{i=1}^{n}y_i yˉ=n1i=1nyi

    E S S \mathrm{ESS} ESSExplained Sum of Squares)是回归平方和,反映了观测值中被模型“解释”了的那部分方差; R S S \mathrm{RSS} RSSResidual Sum of Squares)是残差平方和(也叫作剩余平方和),反映了观测值中没有被模型“解释”的那部分方差;而 T S S \mathrm{TSS} TSSTotal Sum of Squares)是观测值中所有的方差。

    R 2 R^2 R2 越大时,代表被回归模型“解释”了的方差的比例越高,也就说明模型的拟合效果越好。

    我们会在下文中证明

    T S S = E S S + R S S

    (3.8)TSS=ESS+RSS" role="presentation" style="position: relative;">(3.8)TSS=ESS+RSS
    TSS=ESS+RSS(3.8)

    此外,值得注意的是:

    推论(T3.1): 当模型使用的自变量增多(在原来模型的基础上增加自变量;第 3 小节有详细说明), R 2 R^2 R2 总是会不变或升高(至少不下降)。

    因此,为了减少模型包含“无关”自变量使得 R 2 R^2 R2 升高的 bias,一般我们还会计算调整 R 2 R^2 R2(Adjusted R-Square; a d j .   R 2 \mathrm{adj.} \, R^2 adj.R2)来衡量模型的拟合效果:

    a d j .   R 2 = 1 − R S S n − p − 1 T S S n − 1 = 1 − ( 1 − R 2 ) n − 1 n − p − 1

    adj.R2=1RSSnp1TSSn1(3.9)=1(1R2)n1np1" role="presentation" style="position: relative;">adj.R2=1RSSnp1TSSn1(3.9)=1(1R2)n1np1
    adj.R2=1n1TSSnp1RSS=1(1R2)np1n1(3.9)

    其中 n n n 是观测值的数量;而 p p p 是自变量的数量。调整 R 2 R^2 R2 并不总是随着自变量数量的增多而增大。

    另外,无论是 R 2 R^2 R2 还是调整 R 2 R^2 R2 都只是衡量模型对观测值拟合效果的指标,而不能作为模型是否“正确”的衡量指标 [ref 9]。 R 2 R^2 R2 或调整 R 2 R^2 R2 都没有对模型的前提假设进行诊断。“错误”的模型可能得到较高的 R 2 R^2 R2,而“正确”的模型也可能得到较低的 R 2 R^2 R2

    1.2. 模型的 F F F 检验

    我们知道,统计学中仅仅求得一个点估计值往往是不够的,经常还需要计算出这个点估计值的“可靠程度”,即要进行假设检验。在求得回归系数的估计值之后,我们自然地想要对每个回归系数进行检验;一般会检验每个回归系数是否为 0,也就是去检查对应的自变量是否和因变量显著相关。我们可以利用 F F F 检验对自变量整体进行检验或者利用 t t t 检验对每个自变量进行单独的检验。

    值得注意的是,无论是 F F F 检验 还是 t t t 检验,都是建立在以下几个前提条件上的(我们在前文《2》中已经介绍过这几个条件):

    E [ ϵ ∣ X ] = 0

    (3.10)E[ϵ|X]=0" role="presentation">(3.10)E[ϵ|X]=0
    E[ϵX]=0(3.10)

    var [ ϵ ∣ X ] = σ 2 I n

    (3.11)var[ϵ|X]=σ2In" role="presentation" style="position: relative;">(3.11)var[ϵ|X]=σ2In
    var[ϵX]=σ2In(3.11)

    ϵ ∼ N ( 0 , σ 2 I n )

    (3.12)ϵN(0,σ2In)" role="presentation" style="position: relative;">(3.12)ϵN(0,σ2In)
    ϵN(0,σ2In)(3.12)

    rank ( X ) = p + 1

    (3.13)rank(X)=p+1" role="presentation" style="position: relative;">(3.13)rank(X)=p+1
    rank(X)=p+1(3.13)

    F F F 检验

    在求得回归系数估计值后,我们可以首先检验模型是否“显著”,或者说检验自变量是否整体上和因变量显著相关( F F F 检验);更具体地,就是去检验自变量是否整体上对模型的拟合效果有“显著”的贡献。

    从上一小节 1.1 中我们知道当移除模型中某些自变量后,模型的拟合效果不变或降低。如果某些自变量和因变量不显著相关,或者说这些自变量对模型的拟合没有贡献,那删除这些自变量可以使模型变得简洁,同时不”显著“降低模型的拟合效果。一个特殊情形是如果所有自变量在整体上对模型拟合没有贡献,那么可以删去所有自变量而只保留偏移项。

    线性回归模型(OLS)的 F F F 检验意在检查自变量是否整体上对模型的拟合效果有“显著”的贡献。根据式(3.1),我们将要检验的模型记为 test model:

    Test Model   : y = X β + ϵ

    (3.14)Test Model:y=Xβ+ϵ" role="presentation" style="position: relative;">(3.14)Test Model:y=Xβ+ϵ
    Test Model:y=Xβ+ϵ(3.14)

    其中 ϵ ∼ N ( 0 , σ 2 I n ) \boldsymbol{\epsilon} \sim \mathcal{N}(\boldsymbol{0}, \sigma^2 \mathbf{I}_n) ϵN(0,σ2In)。或者依照单个观测值表示为:

    Test Model   : y i = β 0 + β 1 x i 1 + β 2 x i 2 + ⋯ + β p x i p + ϵ i

    (3.15)Test Model:yi=β0+β1xi1+β2xi2++βpxip+ϵi" role="presentation" style="position: relative;">(3.15)Test Model:yi=β0+β1xi1+β2xi2++βpxip+ϵi
    Test Model:yi=β0+β1xi1+β2xi2++βpxip+ϵi(3.15)

    F F F 检验的零假设( H 0 \mathrm{H}_0 H0)为自变量整体上对模型的拟合效果没有“显著”的贡献,所有的自变量可以从模型中移除;其对应的模型记为零模型(null model):

    H 0   : β 1 = β 2 = ⋯ = β p = 0

    (3.16)H0:β1=β2==βp=0" role="presentation" style="position: relative;">(3.16)H0:β1=β2==βp=0
    H0:β1=β2==βp=0(3.16)

    Null Model   : y i = β 0 + ϵ i

    (3.17)Null Model:yi=β0+ϵi" role="presentation" style="position: relative;">(3.17)Null Model:yi=β0+ϵi
    Null Model:yi=β0+ϵi(3.17)

    零模型用矩阵形式表示为:

    Null Model   : y = β 0 + ϵ

    (3.18)Null Model:y=β0+ϵ" role="presentation" style="position: relative;">(3.18)Null Model:y=β0+ϵ
    Null Model:y=β0+ϵ(3.18)

    而备择假设 H 1 \mathrm{H}_1 H1 为自变量整体上对模型的拟合效果有“显著”的贡献,不应该将所有自变量从模型中移除;其对应的模型记为扩展模型(extended model):

    H 1   : ∃   j ∈ { 1 , 2 , ⋯   , p } ,  s.t.  β j ≠ 0

    (3.19)H1:j{1,2,,p}, s.t. βj0" role="presentation" style="position: relative;">(3.19)H1:j{1,2,,p}, s.t. βj0
    H1:j{1,2,,p}, s.t. βj=0(3.19)

    Extended Model   : y i = β 0 + β 1 x i 1 + β 2 x i 2 + ⋯ + β p x i p + ϵ i ; ∃   j ∈ { 1 , 2 , ⋯   , p } ,  s.t.  β j ≠ 0

    Extended Model:yi=β0+β1xi1+β2xi2++βpxip+ϵi;(3.20)j{1,2,,p}, s.t. βj0" role="presentation" style="position: relative;">Extended Model:yi=β0+β1xi1+β2xi2++βpxip+ϵi;(3.20)j{1,2,,p}, s.t. βj0
    Extended Model:yi=β0+β1xi1+β2xi2++βpxip+ϵi;j{1,2,,p}, s.t. βj=0(3.20)

    扩展模型用矩阵形式表示为:

    Extended Model   : y = X β + ϵ ; ∃   j ∈ { 1 , 2 , ⋯   , p } ,  s.t.  β j ≠ 0

    Extended Model:y=Xβ+ϵ;(3.21)j{1,2,,p}, s.t. βj0" role="presentation" style="position: relative;">Extended Model:y=Xβ+ϵ;(3.21)j{1,2,,p}, s.t. βj0
    Extended Model:y=Xβ+ϵ;j{1,2,,p}, s.t. βj=0(3.21)

    简单来说,extended model 使用了 p 个自变量,其回归系数至少有一个不为 0。此外,在进行 F F F 检验之前,我们添加了式(3.10)到式(3.13)所描述的几个条件;那么式(3.18)和式(3.21)都有 ϵ ∼ N ( 0 , σ 2 I n ) \boldsymbol{\epsilon} \sim \mathcal{N}(\boldsymbol{0}, \sigma^2 \mathbf{I}_n) ϵN(0,σ2In)

    为了避免混淆,下文中我们分别对 null model 和 extended model 的统计量加注上标 (null) 和 (ext)。

    F F F 检验中,我们构建一个 F F F 统计量 E S S (ext) / p R S S (ext) / ( n − p − 1 ) \frac{ \mathrm{ESS}^{\text{(ext)}} / p}{ \mathrm{RSS}^{\text{(ext)}} / (n-p-1)} RSS(ext)/(np1)ESS(ext)/p;其中 E S S (ext) \mathrm{ESS}^{\text{(ext)}} ESS(ext) R S S (ext) \mathrm{RSS}^{\text{(ext)}} RSS(ext) 的计算就是式(3.5)和式(3.6)。我们发现(证明过程见第 3 节):

    R S S (null) = T S S (ext)

    (3.22)RSS(null)=TSS(ext)" role="presentation" style="position: relative;">(3.22)RSS(null)=TSS(ext)
    RSS(null)=TSS(ext)(3.22)

    于是,

    E S S (ext) = T S S (ext) − R S S (ext) = R S S (null) − R S S (ext)

    ESS(ext)=TSS(ext)RSS(ext)(3.23)=RSS(null)RSS(ext)" role="presentation" style="position: relative;">ESS(ext)=TSS(ext)RSS(ext)(3.23)=RSS(null)RSS(ext)
    ESS(ext)=TSS(ext)RSS(ext)=RSS(null)RSS(ext)(3.23)

    所以我们可以将上述 F F F 统计量的分子看成是两个模型的 R S S \mathrm{RSS} RSS 的差值,从直观上这也符合 F F F 检验的初衷。也就是说我们可以将线性回归模型的 F F F 检验看作是比较 null model 和 extended model 之间的 R S S \mathrm{RSS} RSS 的差异是否显著。

    我们可以证明在零假设条件下,上述统计量符合自由度是 p p p 和 的 n − p − 1 n-p-1 np1 F F F 分布(证明过程见第 3 节):

    E S S (ext) / p R S S (ext) / ( n − p − 1 ) ∼ F p , n − p − 1

    (3.24)ESS(ext)/pRSS(ext)/(np1)Fp,np1" role="presentation" style="position: relative;">(3.24)ESS(ext)/pRSS(ext)/(np1)Fp,np1
    RSS(ext)/(np1)ESS(ext)/pFp,np1(3.24)

    于是,我们可以根据式(3.24)计算出 p p p-value,从而对自变量整体是否对模型拟合有显著贡献作出统计检验。

    类似上一小节讲到拟合优度时提到的, F F F 检验只是检查模型自变量整体在拟合效果上是否显著;并不作为模型是否“正确”的指标;它并没有对模型的前提假设进行诊断。

    1.3. 回归系数的 t t t 检验

    如果 F F F 检验的结果是自变量整体没有和因变量显著相关,那么需要根据数据的特性对现有自变量作一些变换,或者重新选择一些新的自变量,然后再构建新的模型。否则,如果 F F F 检验的结果显著,我们需要进一步对每个自变量作单独的检验,即 t t t 检验。当然,我们需要注意 t t t 检验中可能存在的多重检验带来的(假阳性)问题,尤其是自变量数量多的时候。

    假设我们想要检验第 j j j 个自变量是否和因变量显著相关。此时, t t t 检验的零假设(null hypothesis)为第 j j j 个自变量和因变量没有显著相关,即:

    H 0   : β j = 0

    (3.25)H0:βj=0" role="presentation" style="position: relative;">(3.25)H0:βj=0
    H0:βj=0(3.25)

    注意这里 t t t 检验在检验回归系数是否为 0,也可以用类似的方法对偏移项 β 0 \beta_0 β0 是否为 0 进行检验。

    t t t 检验的备择假设为第 j j j 个自变量和因变量显著相关,即:

    H 1   : β j ≠ 0

    (3.26)H1:βj0" role="presentation" style="position: relative;">(3.26)H1:βj0
    H1:βj=0(3.26)

    假定式(3.10)到式(3.13)所描述的几个假设条件都成立,我们已经在前文《2》中证明了,在零假设条件下,统计量 T j T_j Tj 符合自由度是 n − p − 1 n-p-1 np1 t t t 分布:

    T j = β ^ j s 2 ( X T X ) j j − 1 ∼ t n − p − 1

    (3.27)Tj=β^js2(XTX)jj1tnp1" role="presentation" style="position: relative;">(3.27)Tj=β^js2(XTX)jj1tnp1
    Tj=s2(XTX)jj1 β^jtnp1(3.27)

    其中

    s 2 = ( y − X β ^ ) T ( y − X β ^ ) n − p − 1

    (3.28)s2=(yXβ^)T(yXβ^)np1" role="presentation" style="position: relative;">(3.28)s2=(yXβ^)T(yXβ^)np1
    s2=np1(yXβ^)T(yXβ^)(3.28)

    详细信息可以参见前文《2》中的式(2.11)。

    于是我们可以根据式(3.27)和式(3.28)计算出各个回归系数(包括偏移项)的 T j T_j Tj 值以及 p p p-value,从而对各个自变量是否和因变量显著相关作出统计检验。

    置信区间

    顺便提一下,关于线性回归模型的 t t t 检验,常见的操作还包括回归系数置信区间的计算。这个可以根据式(3.27)和式(3.28)推导得到。比如, β j \beta_j βj γ \gamma γ(比如常见的95%)置信区间可以表示为:

    ( β ^ j − T n − p − 1 − 1 ( 1 + γ 2 )   s . e . ^ ( β ^ j )   ,   β ^ j + T n − p − 1 − 1 ( 1 + γ 2 )   s . e . ^ ( β ^ j ) )

    (3.29)(β^jTnp11(1+γ2)s.e.^(β^j), β^j+Tnp11(1+γ2)s.e.^(β^j))" role="presentation" style="position: relative;">(3.29)(β^jTnp11(1+γ2)s.e.^(β^j), β^j+Tnp11(1+γ2)s.e.^(β^j))
    (β^jTnp11(21+γ)s.e. (β^j), β^j+Tnp11(21+γ)s.e. (β^j))(3.29)

    其中 β ^ j \hat{\beta}_j β^j 的“标准差” s . e . ^ ( β ^ j ) \widehat{\mathrm{s.e.}}(\hat{\beta}_j) s.e. (β^j) 为:

    s . e . ^ ( β ^ j ) = s 2 ( X T X ) j j − 1

    (3.30)s.e.^(β^j)=s2(XTX)jj1" role="presentation" style="position: relative;">(3.30)s.e.^(β^j)=s2(XTX)jj1
    s.e. (β^j)=s2(XTX)jj1 (3.30)

    T m ( ⋅ ) \mathcal{T}_{m}(\cdot) Tm() 是自由度为 m m m t t t 分布的累积分布函数;而 T m − 1 ( ) \mathcal{T}^{-1}_{m}() Tm1() T m ( ⋅ ) \mathcal{T}_{m}(\cdot) Tm() 对应的分位数(quantile)函数。

    下文给出一个 R 语言中线性回归模型的例子,然后介绍其拟合优度的计算、 F F F 检验和 t t t 检验。

    2. 示例:mtcars数据集

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