其实，程序化交易系统并不一定需要通过计算机程序来体现，假如人们可以将预测分析、风险管理和投资策略定量化、原则化、标准化，并形成一个人工识别的组合，这样的一个组合也是一套程序化交易系统。
怎么样使用程序化交易，比编写交易指标更难。指标可以在图上发出一个向上或者向下的箭头，但是，你可能要考虑：
1. 用在什么市场？
2. 用在什么品种？
3. 用在什么合约？
4. 什么时候作为使用起点？
5. 用在什么周期?
6. 使用什么参数？
7. 用什么软件？
8. 人工下单还是电脑下单？
9. 用什么仓位？
10. 用什么价格（开盘、最新价、收盘价）？
11. 在信号发出前下单还是信号发出后下单？
12. 遇到流动性不好的市场怎么办
怎么执行？
程序化交易的一大优点就是在提高人的执行力，系统给出确定的信号，提醒人在适当的时候进行适当的操作，但是，问题在于，你遇到以下情况，该怎么办？
1. 做不进去怎么办？（如涨跌停）
2. 下挫单怎么办？
3. 持续多次亏损怎么办？
4. 持续长时间亏损怎么办？
5. 有了很大盈利开始缩水的时候想不想在系统发出信号前了结？
6. 漏过的信号要不要马上跟进？
7. 是否想过滤一些错误的信号？
8. 信号发出后又消失，消失后又出现，该怎么处理？
由此我们可以看出，程序化交易系统并不仅仅只是一个计算机程序，它是预测、风险管理、投资策略这一组合在计算机中的物化，是很复杂的一套交易体系。