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  • 利用freesurfer6进行海马分割的环境配置和步骤,以及获取海马体积


    利用freesurfer6进行海马分割的环境配置和步骤

      • Matlab Runtime 安装
      • 1. 运行recon-all:
      • 2. 利用 recon-all -s subj -hippocampal-subfields-T1 进行海马分割
      • 3. 结束后需要在/$SUBJECTS_DIR/subject/的文件夹/mri路径下输入下面的代码查看分割情况
      • 4. 在文件SUBJECTS_DIR路径下输入quantifyHippocampalSubfields.sh 收集所有被试的海马体积
      • 参考文献

    在这里插入图片描述

    Matlab Runtime 安装

    一些 freesurfer 模块,例如 fsfast 和子场/核分割工具,需要 matlab 运行时包 (MCR)。 MCR 允许用户运行分布式 matlab

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  • 原文地址:https://blog.csdn.net/xj4math/article/details/133623203
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