R包的尽头是 C/C++

疑似 singleR 包的作者的github

• https://github.com/LTLA?page=2&tab=repositories

他主要使用的语言是 C/R/C++.

R包的尽头是C/C++

barcode counting lib in C++

• https://github.com/LTLA/kaori
• https://ltla.github.io/kaori/

这个包是统计 fastq 文件中 barcode 的数量的。
可以指定最多错配个数。
压缩依赖 Zlib 库。

帮助页面: https://ltla.github.io/kaori/

有待测试:

• 如何调用C/C++代码写R包(.C()和.Call()接口 )： https://zhuanlan.zhihu.com/p/525648754
• 还需要了解 CMake: https://github.com/Kitware/CMake
• 学习 C++ 笔记: https://blog.csdn.net/wangjunliang/article/details/126533710

李恒 的C代码

• bioawk 博客，另一个博客
• bioawk 源码@github
• 李恒的博客 2014-2022，主要是C语言