码农知识堂 - 1000bd
  •   Python
  •   PHP
  •   JS/TS
  •   JAVA
  •   C/C++
  •   C#
  •   GO
  •   Kotlin
  •   Swift
  • R语言 R包:mFD 计算与分析功能多样性的一站式综合性


    功能多样性(functional diversity,FD)是指有机体与生物或非生物环境互作的属性特征的多样性。在过去的二十多年中,FD在生态学、生物地理学以及保护研究中的使用越来越多。FD的内涵是非常丰富的,但是目前尚未有统一的一个工具可以实现对FD不同指数与内容的综合分析。本文构建了名为mFD(multifaceted functional diversity)的R包,可以基于物种集合矩阵和物种性状矩阵为输入,来计算绝大多数的FD指数。

    mFD首先可以用于对性状和物种集合数据进行汇总。其次,mFD可以计算物种对之间的性状距离,以帮助用户确认是否需要将物种聚类成功能实体,进而计算多维度的功能空间。为了帮助用户选择最合适的功能空间以用于计算多维度的功能多样性,mFD提供了两个函数来评估每个功能空间的质量。

    第三,mFD提供了6个核心函数用于计算16个FD指数,可以是基于性状距离、功能实体或者物种位置。mFD同时提供了基于ggplot的绘图功能,可以通过自定义与高分辨率的绘图来展示FD指数。所有函数都有自带的内部的校正过程,可以自检自查。为了帮助更多用户使用,本文作者提供了5个step-by-step的网页教程。其中General Workflow是比较齐全的介绍。下面部分的入门级教程简介基于General Workflow(https://cran.r-project.org/web/packages/mFD/vignettes/mFD_general_workflow.html)。更多详细内容,请参考mFD使用手册,链接如下:https://cloud.r-project.org/web/packages/mFD/mFD.pdf。

    mFD包内嵌的练习数据是“果篮里装水果”,共有3个数据集。第一个是每种水果的性状(相当于物种的性状),共包括了

  • 相关阅读:
    Windows-Oracle19c 安装详解-含Navicate远程连接配置 - 同时连接Oracle11g和Oracle19c
    高校节能环保建设
    你是否感受到AI就在身边?
    云备份——初步认识及环境搭建
    [蓝牙 Mesh & Zephyr]-[005]-Key
    网络安全 DVWA通关指南 SQL Injection(SQL注入)
    性能测试岗位能力模型
    mac环境下搭建frida环境并连接网易mumu模拟器
    Vue.js核心技术解析与uni-app跨平台实战开发学习笔记 第7章 Vue.js高级进阶 7.7 watch侦听属性
    成都瀚网科技有限公司:抖店怎么开通直播?
  • 原文地址:https://blog.csdn.net/Mrrunsen/article/details/126706586
  • 最新文章
  • 沪漂五周年了:我越来越迷茫了
    Agentic Skill Routing 实战:别再把所有 Skill 塞进 AI Agent 上下文
    MySQL-Seconds_behind_master的精度误差
    [MAF预定义ChatClient中间件-03]CachingChatClient——利用缓存省钱省时间
    AI的至暗历史:从万众期待到被政府撤资,AI的两次死亡徘徊
    Agent OS :五种驯服不确定性的范式
    PortSwigger SQL注入LAB11
    数据库即时编译JIT
    [Begin]AI Learn Data Day 0
    深度学习进阶(二十七)现代 LLM 的核心架构设计其二:SwiGLU
  • 热门文章
  • 十款代码表白小特效 一个比一个浪漫 赶紧收藏起来吧!!!
    奉劝各位学弟学妹们,该打造你的技术影响力了!
    五年了,我在 CSDN 的两个一百万。
    Java俄罗斯方块,老程序员花了一个周末,连接中学年代!
    面试官都震惊,你这网络基础可以啊!
    你真的会用百度吗?我不信 — 那些不为人知的搜索引擎语法
    心情不好的时候,用 Python 画棵樱花树送给自己吧
    通宵一晚做出来的一款类似CS的第一人称射击游戏Demo!原来做游戏也不是很难,连憨憨学妹都学会了!
    13 万字 C 语言从入门到精通保姆级教程2021 年版
    10行代码集2000张美女图,Python爬虫120例,再上征途
小工具 小游戏
Copyright © 2022 侵权请联系2656653265@qq.com    京ICP备2022015340号-1

京公网安备 11010502049817号