码农知识堂 - 1000bd
  •   Python
  •   PHP
  •   JS/TS
  •   JAVA
  •   C/C++
  •   C#
  •   GO
  •   Kotlin
  •   Swift
  • 人类或小鼠染色体长度文件获取 hg19 mm10.chrom.sizes


    创作日志: scHiCluster源代码中只给了人类的常染色体长度文件,小鼠的还需自己补充。


    在UCSC找到的,这里面的比较全面:

    人类hg19 染色体长度链接
    人类hg38 染色体长度链接
    小鼠mm9 染色体长度链接
    小鼠mm10 染色体长度链接

    比较懒的话我这里有现成的:
    单位bp,只需要常染色体长度的话,把chrX和chrY的删去就好了。

    hg19.chrom.sizes
    chr1	249250621
    chr2	243199373
    chr3	198022430
    chr4	191154276
    chr5	180915260
    chr6	171115067
    chr7	159138663
    chrX	155270560
    chr8	146364022
    chr9	141213431
    chr10	135534747
    chr11	135006516
    chr12	133851895
    chr13	115169878
    chr14	107349540
    chr15	102531392
    chr16	90354753
    chr17	81195210
    chr18	78077248
    chr20	63025520
    chrY	59373566
    chr19	59128983
    chr22	51304566
    chr21	48129895
    
    • 1
    • 2
    • 3
    • 4
    • 5
    • 6
    • 7
    • 8
    • 9
    • 10
    • 11
    • 12
    • 13
    • 14
    • 15
    • 16
    • 17
    • 18
    • 19
    • 20
    • 21
    • 22
    • 23
    • 24
    hg38.chrom.sizes
    chr1	248956422
    chr2	242193529
    chr3	198295559
    chr4	190214555
    chr5	181538259
    chr6	170805979
    chr7	159345973
    chrX	156040895
    chr8	145138636
    chr9	138394717
    chr11	135086622
    chr10	133797422
    chr12	133275309
    chr13	114364328
    chr14	107043718
    chr15	101991189
    chr16	90338345
    chr17	83257441
    chr18	80373285
    chr20	64444167
    chr19	58617616
    chrY	57227415
    chr22	50818468
    chr21	46709983
    
    • 1
    • 2
    • 3
    • 4
    • 5
    • 6
    • 7
    • 8
    • 9
    • 10
    • 11
    • 12
    • 13
    • 14
    • 15
    • 16
    • 17
    • 18
    • 19
    • 20
    • 21
    • 22
    • 23
    • 24
    mm9.chrom.sizes
    chr1	197195432
    chr2	181748087
    chr3	159599783
    chr4	155630120
    chr5	152537259
    chr6	149517037
    chr7	152524553
    chr8	131738871
    chr9	124076172
    chr10	129993255
    chr11	121843856
    chr12	121257530
    chr13	120284312
    chr14	125194864
    chr15	103494974
    chr16	98319150
    chr17	95272651
    chr18	90772031
    chr19	61342430
    chrX	166650296
    chrY	15902555
    
    • 1
    • 2
    • 3
    • 4
    • 5
    • 6
    • 7
    • 8
    • 9
    • 10
    • 11
    • 12
    • 13
    • 14
    • 15
    • 16
    • 17
    • 18
    • 19
    • 20
    • 21
    mm10.chrom.sizes
    chr1	195471971
    chr2	182113224
    chrX	171031299
    chr3	160039680
    chr4	156508116
    chr5	151834684
    chr6	149736546
    chr7	145441459
    chr10	130694993
    chr8	129401213
    chr14	124902244
    chr9	124595110
    chr11	122082543
    chr13	120421639
    chr12	120129022
    chr15	104043685
    chr16	98207768
    chr17	94987271
    chrY	91744698
    chr18	90702639
    chr19	61431566
    
    • 1
    • 2
    • 3
    • 4
    • 5
    • 6
    • 7
    • 8
    • 9
    • 10
    • 11
    • 12
    • 13
    • 14
    • 15
    • 16
    • 17
    • 18
    • 19
    • 20
    • 21
  • 相关阅读:
    Nginx实现反向代理、负责均衡、动静分离
    如何实现两栏布局,右侧自适应?三栏布局,中间自适应?
    学习阿里如何进行数据指标体系的治理
    【✨十五天搞定电工基础】电阻电路的分析方法
    java数据结构与算法刷题-----LeetCode108:将有序数组转换为二叉搜索树
    探索人工智能 | 模型训练 使用算法和数据对机器学习模型进行参数调整和优化
    pytest + yaml 框架 -55. raw 不转义模板语法
    Allegro166版本如何在颜色管理器中实时显示层面操作指导
    MySQL 教程 2.4
    【PHP库】phpseclib - sftp远程文件操作
  • 原文地址:https://blog.csdn.net/qq_43722079/article/details/126541387
  • 最新文章
  • 攻防演习之三天拿下官网站群
    数据安全治理学习——前期安全规划和安全管理体系建设
    企业安全 | 企业内一次钓鱼演练准备过程
    内网渗透测试 | Kerberos协议及其部分攻击手法
    0day的产生 | 不懂代码的"代码审计"
    安装scrcpy-client模块av模块异常,环境问题解决方案
    leetcode hot100【LeetCode 279. 完全平方数】java实现
    OpenWrt下安装Mosquitto
    AnatoMask论文汇总
    【AI日记】24.11.01 LangChain、openai api和github copilot
  • 热门文章
  • 十款代码表白小特效 一个比一个浪漫 赶紧收藏起来吧!!!
    奉劝各位学弟学妹们,该打造你的技术影响力了!
    五年了,我在 CSDN 的两个一百万。
    Java俄罗斯方块,老程序员花了一个周末,连接中学年代!
    面试官都震惊,你这网络基础可以啊!
    你真的会用百度吗?我不信 — 那些不为人知的搜索引擎语法
    心情不好的时候,用 Python 画棵樱花树送给自己吧
    通宵一晚做出来的一款类似CS的第一人称射击游戏Demo!原来做游戏也不是很难,连憨憨学妹都学会了!
    13 万字 C 语言从入门到精通保姆级教程2021 年版
    10行代码集2000张美女图,Python爬虫120例,再上征途
Copyright © 2022 侵权请联系2656653265@qq.com    京ICP备2022015340号-1
正则表达式工具 cron表达式工具 密码生成工具

京公网安备 11010502049817号