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  • 叶绿体基因组完成图重磅来袭!


    小基因组特色项目介绍之叶绿体基因组完成图:

    01  植物叶绿体介绍

    叶绿体(chloroplast,cpDNA)是藻类和植物体绿色细胞中存在的有色质体,虽然受限于核基因组,但拥有自身的遗传物质和遗传体系,是一种半自主细胞器。叶绿体参与细胞分化、细胞信息传递和细胞凋亡等过程。随着高通量测序技术的快速发展,利用叶绿体来研究细胞器的起源、结构、进化正受到越来越广泛的关注。

    常见的植物叶绿体基因组图谱如下:


    02  工作流程 

    凌恩负责对每一个样本的叶绿体DNA (cpDNA) 进行富集及抽提,有自主研发的细胞器提取技术,提取经验丰富。有专业团队负责跟进每一个项目,从细胞器DNA制备、Hiseq建库及测序、后续生物信息分析,直至为客户提供满意的结果。为了获得高质量的叶绿体基因组完成图,推荐结合Pacbio三代测序。

    部分高级分析结果展示如下:

     

     基因组共线性比较例图

     

                   

    Core-Pan分析例图

     

      

    物种进化分析例图

     03  公司优势及项目经验

    我们的优势:

    1. 项目经验丰富,已经完成及在线的叶绿体已逾100个;

    2. 组装经验丰富,提供极高质量的叶绿体基因组完成图,超过98%的样品组装到完成图水平;

    3. 各种个性化分析,致力于满足老师的各种分析需求。

    对目前已经完成及在线的叶绿体进行物种分类,主要分布于26种不同的科:

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