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  • 记录安装Cytoscape的过程


    一、安装前的准备工作

    1、先java

    看了大佬们的安装教程:
    看到说先要安装对应的Java才能下载相应的cytoscape,因cytoscape是基于java的软件。
    cytoscape安装教程1
    cytoscape安装教程2

    然后,自查了自己电脑上的Java版本,应该为jdk 11,对应cytoscape 3.9.1


    在这里插入图片描述


    2、在Java基础上,下载安装cytospace

    (1) 下载安装cytospace过程中出现的问题

    然后,按照安装教程来下载windows-64bit 的cytoscape版本,然后下载到差不多 1 4 \frac{1}{4} 41​接近50m左右,共270多m,说下载失败,需要获得授权。


    在这里插入图片描述


    (2)解决问题

    然后,有文章说可以在官网测试
    但我点击不了windows.bat,来进行测试,试图安装System Checker Script[图a],出现无法访问网站[图b],可能需要翻墙。


    图一
    图二


    (3)无法翻墙的基础上,去解决问题

    发现了cytoscape的安装及使用,然后直接这篇博客中的百度网盘中的cytoscape.exe应用程序进行下载,因本机有java11版本,所以只安装了cytoscape,没有安装附带的Java。

    (4)安装结束

    安装完后,出现弹窗,说cyee版本改变,不知道会不会对后续使用有影响。


    在这里插入图片描述


    为了以防万一,搜索了一些安装后问题的教程:
    Cytospace安装后无法打开,其中有其他的相关情况的博客链接。

    二、安装后的使用

    见互作网络可视化-Cytoscape简单教程
    目前,没有数据文件,暂未开始使用。

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  • 原文地址:https://blog.csdn.net/qq_45866781/article/details/128032871
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