• R语言在DSSAT模型的气候、土壤、管理措施等数据准备,自动化模拟和结果分析


    随着基于过程的作物生长模型(Process-based Crop Growth Simulation Model)的发展,R语言在作物生长模型和数据分析、挖掘和可视化中发挥着越来越重要的作用。想要成为一名优秀的作物模型使用者与科研团队不可或缺的人才,除了掌握对作物模型相关知识之外,还要掌握模型的快速模拟和高效数据分析能力。Decision Support Systems for Agrotechnology Transfer (简称DSSAT)模型是世界知名的作物生长模拟模型之一。现有版本V4.7能模拟27种主要农作物的生长发育和产量形成过程,被广泛应用于精细农业、水肥管理、气候变化、粮食安全、土碳循环、环境影响、农业可持续性、农业生态等诸多与农业生产和科研有关的领域。R语言在DSSAT模型的气候、土壤、管理措施等数据准备,自动化模拟和结果分析上都发挥着重要的作用。

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    一、DSSAT模型的高级应用

    1. 作物模型的概念

    2. DSSAT模型发展现状

    3. DSSAT与R语言的安装与介绍

    4. DSSAT模型的高级应用案例

    5. R语言在作物模型参数优化中的应用

    6. R语言在作物模型全球栅格模拟中的应用

    7.R语言在作物模型结果分析和数据可视化中的应用

    二、R语言与数据科学

    1 R语言与数据科学

    1) R语言发展脉络

    2) R语言数据操作技巧

    3) R语言在作物模型中的应用

    2 R语言编程技巧数据操作

    1) R与工作目录

    2) R的数据类型及结构

    3) R中各数据类型的赋值与操作

    各种数据格式的读写及操作

    三、DSSAT模型高级应用技巧

    1 DSSAT模型操作

    1) DSSAT的安装

    2) DSSAT模型操作界面讲解

    2 DSSAT模型源码操作与编译

    1) DSSAT模型源码安装

    2) DSSAT源码的介绍与修改

    3) DSSAT源码的编译

    四、R语言准备DSSAT气象文件

    1 DSSAT自带的气象数据的准备

    2 R语言操作和准备气象文件

    1) DSSAT气象文件的介绍

    2) 日照转辐射算法的编写

    3) DSSAT气象文件的编写

    五、R语言准备DSSAT土壤文件

    1 DSSAT模型的土壤模块及土壤输入参数

    2 DSSAT模型土壤水分-氮素-有机碳模块的主要算法

    3 DSSAT模型土壤参数在数据缺失情况下的近似估算

    4 使用R语言操作和准备土壤输入文件

    5 DSSAT模型全球土壤数据库的使用

    六、R语言准备DSSAT管理文件

    1 DSSAT模型的农田管理措施(播期、密度、施肥、灌溉、有机肥、秸秆还田等)的介绍

    2 使用R语言进行管理文件批量准备(只需要填写excel,就能批量模拟)

    七、R语言准备DSSAT参数文件及批量模拟文件

    1 DSSAT模型的主要遗传参数,包括物种参数、生态型参数、品种参数

    2 主要的参数优化方法

    3 使用R语言进行参数文件准备

    4 使用R语言对批量模拟文件的编

    八、R语言对模拟结果进行数据清洗和整理

    1 使用R语言读取DSSAT文件的模拟结果

    2 对模拟结果进行数据清洗、分类和整理

    九、R语言对模拟结果进行数据分析及绘图

    1 使用R语言对模拟结果进行分析

    2 使用R语言计算模拟结果的MSE、RMSE、MAE、d-value、EF值

    3 使用R语言对模拟结果进行可视化(模拟结果的动态图和1:1图等)

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  • 原文地址:https://blog.csdn.net/zmjia111/article/details/127616815