HVIDB！人类病毒蛋白互作数据库介绍

快速查询病毒与人类蛋白之间的互作

以及新的互作关系预测

病毒感染性疾病是人类卫生系统面临的一大威胁，深入了解病毒与人类之间的蛋白质互作(PPI)有助于推动对发病机制的研究，然而，目前大多数的人类病毒 PPI 数据库资源不完整、缺乏注释。本研究提供了一个全面的人类病毒PPI数据库HVIDB，该数据库可访问地址：http://zzdlab.com/hvidb/。

HVIDB 提供了 48643 个经过实验验证的人病毒 PPI，涵盖35个病毒家族、6633个病毒靶向宿主复合物、3572个宿主因子以及911个人类病毒PPIs的3D结构。此外，该数据库还提供了6790种病毒靶向的人类基因的组织特异性表达图谱和129 种病毒感染后差异表达基因的 Gene Expression Omnibus 系列。

HVIDB的基本功能包含以下五方面：

1、网络信息

HVIDB提供PPI子网，用于查询人类/病毒蛋白

2、结构信息

HVIDB提供经实验验证或预测的人类病毒PPIs及相应互作位点的三维结构图

3、表达信息

PIs在病毒感染后具有组织特异性，HVIDB提供了病毒靶点的差异表达信息，帮助研究者深入了解人类宿主基因对病毒感染的反应方式

4、功能注释

对毒蛋白进行GO、KEGG注释

5、预测平台

HVIDB提供了一个PPI预测平台，可以在缺乏实验信息的情况下快速预测人与病毒蛋白对之间可能的互作关系

图：HVIDB的基本功能

在搜索界面，用户可以通过基因或蛋白质ID、符号、关键字搜索，获得相应的人类病毒PPI网络，通过相应的列表可以获得PPI数据和相关的辅助信息，包括人类病毒PPIs、3D复杂结构信息、病毒靶向人类复合物、差异表达信息和宿主因子等。此外，HVIDB还提供两个单独的模块，用于访问感染病毒后的DEGs和病毒靶向复合物。

参考文献

HVIDB: a comprehensive database for human–virus protein–protein interactions. Brief Bioinform.2021.