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  • 一篇五分生信临床模型预测文章代码复现——Figure 2. 生存分析,箱线图表达改变分析(二)


     

     之前讲过临床模型预测的专栏,但那只是基础版本,下面我们以自噬相关基因为例子,模仿一篇五分文章,将图和代码复现出来,学会本专栏课程,可以具备发一篇五分左右文章的水平:

    本专栏目录如下:

    Figure 1:差异表达基因及预后基因筛选(图片仅供参考) 

    Figure 2. 生存分析,箱线图表达改变分析(图片仅供参考)

    Figure 3. 基因富集分析(图片仅供参考) 

    Figure 4.构建临床预测模型(图片仅供参考)

    Figure 5.训练集训练模型(图片仅供参考)

    Figure 6.测试集测试模型(图片仅供参考) 

    Figure 7.外部数据集验证模型(图片仅供参考)

    Figure 8.生存曲线鲁棒性分析(图片仅供参考)

    FIgure 9.列线图构建,ROC分析,DCA分析(图片仅供参考)

    Figure 10.机制及肿瘤免疫浸润(图片仅供参考)

    上一节讲到预后基因筛选,并且做了森林图,森林图呈现的就是预后相关的基因,那么我们要将这些基因做成生存曲线,并且用箱线图表示基因在肿瘤和正常组织中的表达差异。

    ##################  下面是我们要做的图   #################

     

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  • 原文地址:https://blog.csdn.net/weixin_46500027/article/details/126580170
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