目录
遗传算法(Genetic Algorithm, GA)起源于对生物系统所进行的计算机模拟研究。它是模仿自然界生物进化机制发展起来的随机全局搜索和优化方法,借鉴了达尔文的进化论和孟德尔的遗传学说。其本质是一种高效、并行、全局搜索的方法,能在搜索过程中自动获取和积累有关搜索空间的知识,并自适应地控制搜索过程以求得最佳解。
(1)编码:将问题的候选解用染色体表示,实现解空间向编码空间的映射过程。遗传算法不直接处理解空间的决策变量,而是将其转换成由基因按一定结构组成的染色体。编码方式有很多,如二进制编码、实数向量编码、整数排列编码、通用数据结构编码等等。本文将采用二进制编码的方式,将十进制的变量转换成二进制,用0和1组成的数字串模拟染色体,可以很方便地实现基因交叉、变异等操作。
(2)种群初始化:产生代表问题可能潜在解集的一个初始群体(编码集合)。种群规模设定主要有以下方面的考虑:从群体多样性方面考虑,群体越大越好,避免陷入局部最优;从计算效率方面考虑,群体规模越大将导致计算量的增加。应该根据实际问题确定种群的规模。产生初始化种群的方法通常有两种:一是完全随机的方法产生;二是根据先验知识设定一组必须满足的条件,然后根据这些条件生成初始样本。
(3)计算个体适应度:利用适应度函数计算各个个体的适应度大小。适应度函数(Fitness Function)的选取直接影响到遗传算法的收敛速度以及能否找到最优解,因为在进化搜索中基本不利用外部信息,仅以适应度函数为依据,利用种群每个个体的适应程度来指导搜索。
(4)进化计算:通过选择、交叉、变异,产生出代表新的解集的群体。选择(selection):根据个体适应度大小,按照优胜劣汰的原则,淘汰不合理的个体;交叉(crossover):编码的交叉重组,类似于染色体的交叉重组;变异(mutation):编码按小概率扰动产生的变化,类似于基因突变。
(5)解码:末代种群中的最优个体经过解码实现从编码空间向解空间的映射,可以作为问题的近似最优解。这是整个遗传算法的最后一步,经过若干次的进化过程,种群中适应度最高的个体代表问题的最优解,但这个最优解还是一个由0和1组成的数字串,要将它转换成十进制才能供我们理解和使用。
遗传编码将变量转化为基因组的表示形式,优化变量的编码机制有二进制编码、十进制编码(实数编码)等。
这里简单介绍以下二进制编码的实现原理。例如,求实数区间上函数的最大值,传统的方法是不断调整自变量的值,假设使用二进制编码新式,我们可以由长度6的未穿表示变量,即从000000到111111,并将中间的取值映射到实数区间内。由于哦才能够整数上来看,6位长度二进制表示范围为0~63,所以对应的区间,每个相邻值之间的阶跃值为。这个就是编码的精度,编码精度越高,所得到的解的质量也越高。
在解决高维、连续优化问题等是,经常采用实数编码方式。实数编码的优点是计算精度搞,便于和经典连续优化算法结合。
1)初始化。设置进化代数计数器,设置最大进化代数,随机生成个个体作为初始群体
2)个体评价。计算群体中各个个体的适应度
3)选择运算。将选择算子作用域群体,根据个体适应度,按照一定的规则和方法,选择一些优良个体遗传到下一代群体。
4)交叉运算。将交叉算子作用于群体,对选中的成对个体,以某一概率交换他们之间的部分染色体,产生新的个体
5)变异运算。将变异算子作用于群体,对选中的个体,以某一概率改变某一个或某一些基因值为其他的等位基因。群体P(t)经过选择、交叉、和变异运算之后得到下一代群体。计算其适应度值,并根据适应度值进行排序,准备进行下一代遗传操作。
6)终止条件判断:若,则,转到步骤2);若,则终止计算
旅行商问题(TSP问题)。假设有一个旅行商人要拜访全国31个省会城市,他需要选择所要走的路径,路径的限制是每个城市只能拜访一次,二球要最后回到原来出发的城市。路径的选择要求是:所选的路径的路程之和中的最小。
全国31个省会的坐标为[1304 2312;3639 1315;4177 2244;3712 1399;3488 1535;3326 1556;3238 1229;4196 1044;4312 790;4386 570;3007 1970;2562 1756;2788 1491;2381 1676;1332 695;3715 1678;3918 2179;4061 2370;3780 2212;3676 2578;4029 2838;4263 2931;3429 1908;3507 2376;3394 2643;3439 3201;2935 3240;3140 3550;2545 2357;2778 2826;2370 2975]
仿真过程如下:
1)初始化种群数目,染色体基因维数,最大进化代数
2)产生初始化种群,计算个体适应度值,并进行归一化;采用基于概率的方式选择进行操作的个体,对选中的成对个体,随机交叉所选中的成对城市坐标,以确保交叉后路径每个城市只到访一次;对选中的单个个体,随机交换其中一对城市坐标作为变异操作,产生新的种群,进行下一次遗传操作。
3)判断是否满足条件:若满足,则结束搜索
- %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%遗传算法解决TSP问题%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
- clear all; %清除所有变量
- close all; %清图
- clc; %清屏
- C=[1304 2312;3639 1315;4177 2244;3712 1399;3488 1535;3326 1556;...
- 3238 1229;4196 1044;4312 790;4386 570;3007 1970;2562 1756;...
- 2788 1491;2381 1676;1332 695;3715 1678;3918 2179;4061 2370;...
- 3780 2212;3676 2578;4029 2838;4263 2931;3429 1908;3507 2376;...
- 3394 2643;3439 3201;2935 3240;3140 3550;2545 2357;2778 2826;...
- 2370 2975]; %31个省会城市坐标
- N=size(C,1); %TSP问题的规模,即城市数目
- D=zeros(N); %任意两个城市距离间隔矩阵
- %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%求任意两个城市距离间隔矩阵%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
- for i=1:N
- for j=1:N
- D(i,j)=((C(i,1)-C(j,1))^2+(C(i,2)-C(j,2))^2)^0.5;
- end
- end
- NP=200; %种群规模
- G=1000; %最大遗传代数
- f=zeros(NP,N); %用于存储种群
- F=[]; %种群更新中间存储
- for i=1:NP
- f(i,:)=randperm(N); %随机生成初始种群
- end
- R=f(1,:); %存储最优种群
- len=zeros(NP,1); %存储路径长度
- fitness=zeros(NP,1); %存储归一化适应值
- gen=0;
- %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%遗传算法循环%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
- while gen<G
- %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%计算路径长度%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
- for i=1:NP
- len(i,1)=D(f(i,N),f(i,1));
- for j=1:(N-1)
- len(i,1)=len(i,1)+D(f(i,j),f(i,j+1));
- end
- end
- maxlen=max(len); %最长路径
- minlen=min(len); %最短路径
- %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%更新最短路径%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
- rr=find(len==minlen);
- R=f(rr(1,1),:);
- %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%计算归一化适应值%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
- for i=1:length(len)
- fitness(i,1)=(1-((len(i,1)-minlen)/(maxlen-minlen+0.001)));
- end
- %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%选择操作%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
- nn=0;
- for i=1:NP
- if fitness(i,1)>=rand
- nn=nn+1;
- F(nn,:)=f(i,:);
- end
- end
- [aa,bb]=size(F);
- while aa<NP
- nnper=randperm(nn);
- A=F(nnper(1),:);
- B=F(nnper(2),:);
- %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%交叉操作%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
- W=ceil(N/10); %交叉点个数
- p=unidrnd(N-W+1); %随机选择交叉范围,从p到p+W
- for i=1:W
- x=find(A==B(p+i-1));
- y=find(B==A(p+i-1));
- temp=A(p+i-1);
- A(p+i-1)=B(p+i-1);
- B(p+i-1)=temp;
- temp=A(x);
- A(x)=B(y);
- B(y)=temp;
- end
- %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%变异操作%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
- p1=floor(1+N*rand());
- p2=floor(1+N*rand());
- while p1==p2
- p1=floor(1+N*rand());
- p2=floor(1+N*rand());
- end
- tmp=A(p1);
- A(p1)=A(p2);
- A(p2)=tmp;
- tmp=B(p1);
- B(p1)=B(p2);
- B(p2)=tmp;
- F=[F;A;B];
- [aa,bb]=size(F);
- end
- if aa>NP
- F=F(1:NP,:); %保持种群规模为n
- end
- f=F; %更新种群
- f(1,:)=R; %保留每代最优个体
- clear F;
- gen=gen+1
- Rlength(gen)=minlen;
- end
- figure
- for i=1:N-1
- plot([C(R(i),1),C(R(i+1),1)],[C(R(i),2),C(R(i+1),2)],'bo-');
- hold on;
- end
- plot([C(R(N),1),C(R(1),1)],[C(R(N),2),C(R(1),2)],'ro-');
- title(['优化最短距离:',num2str(minlen)]);
- figure
- plot(Rlength)
- xlabel('迭代次数')
- ylabel('目标函数值')
- title('适应度进化曲线')