matlab spm批量配准

第一次使用matlab spm配准医学图像，使用spm提供的GUI界面，一次只能处理一个图像。
使用一下脚本，可以实现批量配准操作：

spm_jobman('initcfg');
dir_path='E:\\xxx\\processed_t1\\new_MS'
subdir=dir(dir_path)
for i=3:length(subdir)
       %设置source文件地址
        source=fullfile( dir_path, subdir( i ).name, 'new_t1.nii' );
        %设置reference文件地址
        reference=fullfile( dir_path, subdir( i ).name, 'FLAIR_brain_norm.nii' );
        clear matlabbatch
        % 以下spm12默认设置
        matlabbatch{1}.spm.spatial.coreg.estwrite.ref = {reference};
        matlabbatch{1}.spm.spatial.coreg.estwrite.source = {source};
        matlabbatch{1}.spm.spatial.coreg.estwrite.other = {''};
        matlabbatch{1}.spm.spatial.coreg.estwrite.roptions.interp = 4;
        matlabbatch{1}.spm.spatial.coreg.estwrite.roptions.wrap = [0 0 0];
        matlabbatch{1}.spm.spatial.coreg.estwrite.roptions.mask = 0;
        matlabbatch{1}.spm.spatial.coreg.estwrite.roptions.prefix = 'r';
        % 运行
        spm_jobman('run', matlabbatch);
end
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