• 海量数据处理利器 Roaring BitMap 原理介绍


    作者:来自 vivo 互联网服务器团队- Zheng Rui

    本文结合个人理解梳理了BitMap及Roaring BitMap的原理及使用,分别主要介绍了Roaring BitMap的存储方式及三种container类型及Java中Roaring BitMap相关API使用。

    一、引言

    在进行大数据开发时,我们可以使用布隆过滤器和Redis中的HyperLogLog来进行大数据的判重和数量统计,虽然这两种方法节省内存空间并且效率很高,但是也存在一些误差。如果需要100%准确的话,我们可以使用BitMap来存储数据。

    BitMap 位图索引数据结构被广泛地应用于数据存储和数据搜索中,但是对于存储较为分散的数据时,BitMap会占用比较大的内存空间,因此我们更偏向于使用 Roaring BitMap稀疏位图索引进行存储。同时,Roaring BitMap广泛应用于数据库存储和大数据引擎中,例如Hive,Spark,Doris,Kylin等。

    下文将分别介绍 BitMap 和 Roaring BitMap 的原理及其相关应用。

    二、BitMap原理

    BitMap的基本思想就是用bit位来标记某个元素对应的value,而key就是这个元素。

    例如,在下图中,是一个字节代表的8位,下标为1,2,4,6的bit位的值为1,则该字节表示{1,2,4,6}这几个数。

    图片

    在Java中,1个int占用4个字节,如果用int来存储这四个数字的话,那么将需要4 * 4 = 16字节。

    BitMap可以用于快速排序,查找,及去重等操作。优点是占用内存少(相较于数组)和运算效率高,但是缺点也非常明显,无法存储重复的数据,并且在存储较为稀疏的数据时,浪费存储空间较多。

    三、Roaring BitMap 原理

    3.1 存储方式

    为了解决BitMap存储较为稀疏数据时,浪费存储空间较多的问题,我们引入了稀疏位图索引Roaring BitMap。Roaring BitMap 有较高的计算性能及压缩效率。下面简单介绍一下Roaring BitMap的基本原理。

    Roaring BitMap处理int型整数,将32位的int型整数分为高16位和低16位分别进行处理,高16位作为索引分片,而低16位用于存储实际数据。其中每个索引对应一个数据桶(bucket),那么一共可以包含2^16 = 65536个数据块。每个数据桶使用container容器来存储低16位的部分,每个数据桶最多存储2^16 = 65536个数据。

    图片

    如上图所示,高16位作为索引查找具体的数据块,当前索引值为0,低16位作为value进行存储。

    Roaring BitMap在进行数据存储时,会先根据高16位找到对应的索引key(二分查找),低16位作为key对应的value,先通过key检查对应的container容器,如果发现container不存在的话,就先创建一个key和对应的container,否则直接将低16位存储到对应的container中。

    Roaring BitMap的精妙之处在于使用不同类型的container,接下来将对其进行介绍。

    3.2 container类型

    1.ArrayContainer

    顾名思义,ArrayContainer直接采用数组来存储低16位数据,没有采用任何数据压缩算法,适合存储比较稀疏的数据,在Java中,使用short数组来存储,并且占用的内存空间大小和数据量成线性关系。由于short为2字节,因此n个数据为2n字节。ArrayContainer采用二分查找定位有序数组中的元素,因此时间复杂度为O(logN)。ArrayContainer的最大数据量为4096, 4096 * 2b = 8kb。

    2.BitMapContainer

    BitMapContainer采用BitMap的原理,就是一个没有经过压缩处理的普通BitMap,适合存储比较稠密的数据,在Java中使用Long数组存储低16位数据,每一个bit位表示一个数字。由于每个container需要存储2^16 = 65536个数据,如果通过BitMap进行存储的话,需要使用2^16个bit进行存储,即8kb的数据空间。

    可以从下图中看出ArrayContainer和BitMapContainer的内存空间使用关系,当数据量小于4096时,使用ArrayContainer比较合适,当数据量大于等于4096时,使用BitMapContainer更佳。

    图片

    因为BitMap直接使用位运算,所以BitMapContainer的时间复杂度为O(1)。

    3.RunContainer

    RunContainer采用Run-Length Encoding 行程长度编码进行压缩,适合存储大量连续数据。Java中使用short数组进行存储。连续bit位程度越高的话越节省存储空间,最佳场景下(65536个数据全为1)只需要存储4字节。最差场景为所有数据都不连续,所有存储数据位置为奇数或者偶数,这种场景需要存储128kb。由于采用二分查找算法定位元素,因此时间复杂度为O(logN)。

    行程长度编码即的原理是对连续出现的数字进行压缩,只记录初始数字和后续连续数量。

    例如:[1,2,3,4,5,8,9,10]使用编码后的数据为[1,4,8,2]。

    Java 里可以使用runOptinize()方法来对比RunContainer和其他两个Container存储空间大小,如果使用RunContainer存储空间更佳则会进行转化。

    根据上面三个Container类型我们可以得知如何进行选择:

    1. Container默认使用ArrayContainer,当元素数量超过4096时,会由ArrayContainer转换BitMapContainer。

    2. 当元素数量小于等于4096时,BitMapContainer会逆向转换回ArrayContainer。

    3.  正常增删元素不会使Container直接变成RunContainer,而需要用户进行优化方法调用才会转换为最节省空间的Container。

    3.3 Roaring BitMap 相关源码

    介绍完Roaring BitMap的三种container类型以后,让我们了解一下,Roaring BitMap的相关源码。这里介绍一下Java中增加元素的源码实现。

    public void add(final int x) {
        final short hb = Util.highbits(x);
        final int i = highLowContainer.getIndex(hb);
        if (i >= 0) {
          highLowContainer.setContainerAtIndex(i,
              highLowContainer.getContainerAtIndex(i).add(Util.lowbits(x)));
        } else {
          final ArrayContainer newac = new ArrayContainer();
          highLowContainer.insertNewKeyValueAt(-i - 1, hb, newac.add(Util.lowbits(x)));
        }
      }

    Roaring BitMap首先获取添加元素的高16位,然后再调用getIndex获取高16位对应的索引,如果索引大于0,表示已经创建该索引对应的container,故直接添加相应的元素低16位即可;否则的话,说明该索引对应的container还没有被创建,先创建对应的ArrayContainer,再进行元素添加。值得一提的是,在getIndex方法中,使用了二分查找来获取索引值,所以时间复杂度为O(logn)。

    // 包含一个二分查找
    protected int getIndex(short x) {
      // 在二分查找之前,我们先对常见情况优化。
      if ((size == 0) || (keys[size - 1] == x)) {
        return size - 1;
      }
      // 没有碰到常见情况,我们只能遍历这个列表。
      return this.binarySearch(0, size, x);
    }

    对于元素添加,三种Container提供了不同的实现方式,下面将分别介绍。

    1. ArrayContainer

    if (cardinality == 0 || (cardinality > 0
              && toIntUnsigned(x) > toIntUnsigned(content[cardinality - 1]))) {
        if (cardinality >= DEFAULT_MAX_SIZE) {
          return toBitMapContainer().add(x);
        }
        if (cardinality >= this.content.length) {
          increaseCapacity();
        }
        content[cardinality++] = x;
      } else {
        int loc = Util.unsignedBinarySearch(content, 0, cardinality, x);
        if (loc < 0) {
          // 当标签中元素数量等于默认最大值时,把ArrayContainer转换为BitMapContainer
          if (cardinality >= DEFAULT_MAX_SIZE) {
            return toBitMapContainer().add(x);
          }
          if (cardinality >= this.content.length) {
            increaseCapacity();
          }
          System.arraycopy(content, -loc - 1, content, -loc, cardinality + loc + 1);
          content[-loc - 1] = x;
          ++cardinality;
        }
      }
      return this;
    }

    ArrayContainer把添加元素分成两种场景,一种走二分查找,另外一种不走二分查找。

    第一种场景:不走二分查找。

    当基数为0或者值大于container中的最大值,可以直接添加,因为content数组是有序的,最后一个是最大值。

    当基数大于等于默认最大值4096时,ArrayContainer将转换为BitMapContainer。如果基数大于content的数组长度的话,需要将content进行扩容。最后进行赋值即可。

    第二种场景:走二分查找。

    先通过二分查找找到对应的插入位置,如果返回loc大于等于0,说明存在,直接返回即可,如果小于0才进行后续插入。后续操作同上,当基数大于等于默认最大值4096时,ArrayContainer将转换为BitMapContainer。如果基数大于content的数组长度的话,需要将content进行扩容。最后通过拷贝数组将元素插入到content数组中。

    2. BitMapContainer

    public Container add(final short i) {
      final int x = Util.toIntUnsigned(i);
      final long previous = BitMap[x / 64];
      long newval = previous | (1L << x);   BitMap[x / 64] = newval;
      if (USE_BRANCHLESS) {
        cardinality += (previous ^ newval) >>> x;
      } else if (previous != newval) {
        ++cardinality;
      }
      return this;
    }

    BitMap数组为BitMapContainer的存储容器存放数据的内容,数据类型为long,在这里我们只需要找到x在BitMap中的位置,并且把相应的bit位置1即可。x/64就是找到对应long的旧值,1L<

    3. RunContainer

    public Container add(short k) {
       
      int index = unsignedInterleavedBinarySearch(valueslength, 0, nbrruns, k);
      if (index >= 0) {
        return this;// already there
      }
      index = -index - 2;
      if (index >= 0) {
        int offset = toIntUnsigned(k) - toIntUnsigned(getValue(index));
        int le = toIntUnsigned(getLength(index));
        if (offset <= le) {
          return this;
        }
        if (offset == le + 1) {
          // we may need to fuse
          if (index + 1 < nbrruns) {
            if (toIntUnsigned(getValue(index + 1)) == toIntUnsigned(k) + 1) {
              // indeed fusion is needed
              setLength(index,
                  (short) (getValue(index + 1) + getLength(index + 1) - getValue(index)));
              recoverRoomAtIndex(index + 1);
              return this;
            }
          }
          incrementLength(index);
          return this;
        }
        if (index + 1 < nbrruns) {
          // we may need to fuse
          if (toIntUnsigned(getValue(index + 1)) == toIntUnsigned(k) + 1) {
            // indeed fusion is needed
            setValue(index + 1, k);
            setLength(index + 1, (short) (getLength(index + 1) + 1));
            return this;
          }
        }
      }
      if (index == -1) {
        // we may need to extend the first run
        if (0 < nbrruns) {
          if (getValue(0) == k + 1) {
            incrementLength(0);
            decrementValue(0);
            return this;
          }
        }
      }
      makeRoomAtIndex(index + 1);
      setValue(index + 1, k);
      setLength(index + 1, (short) 0);
      return this;
    }

    RunContainer中的两个数据结构,nbrruns表示有多少段行程,数据类型为int,valueslength数组表示所有的行程,数据类型为short。

    1. 首先,使用二分查找+顺序查找在valueslength数组中查找元素k的插入位置index。如果查找到的index结果大于等于0那就说明k是某个行程起始值,已经存在,直接返回。

    2. -index-2是为了指向前一个行程起始值的索引。

    3. 接下来是一些偏移量和索引值的判断,主要是为了确认k是否落在上一个行程里,或者外面,如果落在上一个行程里,则直接返回,否则需要新建一个行程或者就近与一个行程混合并且将行程长度加1。

    3.4 BitMap 和 Roaring BitMap 存储情况对比

    public static void count(Integer inputSize) {         RoaringBitMap BitMap = new RoaringBitMap();         BitMap.add(0L, inputSize);
     
            //获取BitMap个数
            int cardinality = BitMap.getCardinality();
     
            //获取BitMap压缩大小
            int compressSizeIntBytes = BitMap.getSizeInBytes();
     
            //删除压缩(移除行程编码,将container退化为BitMapContainer 或 ArrayContainer)         BitMap.removeRunCompression();
     
            //获取BitMap不压缩大小
            int uncompressSizeIntBytes = BitMap.getSizeInBytes();
     
            System.out.println("Roaring BitMap个数:" + cardinality);
            System.out.println("最好情况,BitMap压缩大小:" + compressSizeIntBytes / 1024 + "KB");
            System.out.println("最坏情况,BitMap不压缩大小:" + uncompressSizeIntBytes / 1024 / 1024 + "MB");
     
            BitSet bitSet = new BitSet();
            for (int i = 0; i < inputSize; i++) {
                bitSet.set(i);
            }
            //获取BitMap大小
            int size = bitSet.size();
     
            System.out.println("BitMap个数:" + bitSet.length());
            System.out.println("BitMap大小:" + size / 8 / 1024 / 1024 + "MB");
        }

    上述代码使用了Java内置的BitMap(BitSet) 和 Roaring BitMap进行存储大小对比,输出结果如下所示。

    • Roaring BitMap个数:1000000000

    • 最好情况,BitMap压缩大小:149KB

    • 最坏情况,BitMap不压缩大小:119MB

    • Roaring BitMap个数:1000000000

    • BitMap大小:128MB

    可以发现,Roaring BitMap的压缩性能效果非常好,同等情况下,是BitMap占用内存的近一千分之一。在退化成BitMapContainer/arrayContainer之后也仍然比使用基本的BitMap存储效果好一些。

    四、Roaring BitMap 使用

    4.1 Java 中相关 API 使用

    在Java中,Roaring BitMap提供了交并补差集等操作,如下代码所示,列举了Java中roaing BitMap的相关API使用方式。

    //添加单个数字
    public void add(final int x)
    
    //添加范围数字
    public void add(final long rangeStart, final long rangeEnd)
    
    //移除数字
    public void remove(final int x)
    
    //遍历RBM
    public void forEach(IntConsumer ic)
    
    //检测是否包含
    public boolean contains(final int x)
    
    //获取基数
    public int getCardinality()
    
    //位与,取两个RBM的交集,当前RBM会被修改
    public void and(final RoaringBitMap x2)
    
    //同上,但是会返回一个新的RBM,不会修改原始的RBM,线程安全
    public static RoaringBitMap and(final RoaringBitMap x1, final RoaringBitMap x2)
    
    //位或,取两个RBM的并集,当前RBM会被修改
    public void or(final RoaringBitMap x2)
    
    //同上,但是会返回一个新的RBM,不会修改原始的RBM,线程安全
    public static RoaringBitMap or(final RoaringBitMap x1, final RoaringBitMap x2)
    
    //异或,取两个RBM的对称差,当前RBM会被修改
    public void xor(final RoaringBitMap x2)
    
    //同上,但是会返回一个新的RBM,不会修改原始的RBM,线程安全
    public static RoaringBitMap xor(final RoaringBitMap x1, final RoaringBitMap x2)
    
    //取原始值和x2的差集,当前RBM会被修改
    public void andNot(final RoaringBitMap x2)
    
    //同上,但是会返回一个新的RBM,不会修改原始的RBM,线程安全
    public static RoaringBitMap andNot(final RoaringBitMap x1, final RoaringBitMap x2)
    
    //序列化
    public void serialize(DataOutput out) throws IOException
    public void serialize(ByteBuffer buffer)
    
    //反序列化
    public void deserialize(DataInput in) throws IOException
    public void deserialize(ByteBuffer bbf) throws IOException

    对于序列化来说,Roaring BitMap官方定义了一套序列化规则,用来保证不同语言实现的兼容性。

    图片

    Java中可以使用serialize方法进行序列化,deserialize方法进行反序列化。

    4.2 业务实际场景应用

    Roaring BitMap可以用来构建大数据标签,针对类型特征来创建对应的标签。

    在我们的业务场景中,有很多需要基于人群标签进行交并补集运算的场景,下面以一个场景为例,我们需要计算每天某个设备接口 在设备标签A上的查询成功率,因为设备标签A中的设备不是所有都活跃在网的,所以我们需要将设备标签A与每日日活人群标签取交集,得到的交集大小才能用作成功率计算的分母,另外拿查询成功的标签人群做分子来进行计算即可,查询时长耗时为1s。

    假如没有使用标签保存集合之前,我们需要在hive表中查询出同时满足当天在网的活跃用户和设备A的用户数量,查询时长耗时在几分钟以上。两种方式相比之下,使用Roaring BitMap查询的效率更高。

    图片

    五、总结

    本文结合个人理解梳理了BitMap及Roaring BitMap的原理及使用,分别主要介绍了Roaring BitMap的存储方式及三种container类型及Java中Roaring BitMap相关API使用,如有不足和优化建议,也欢迎大家批评指正。

    参考资料:

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