数据介绍:
PCA实现高维数据可视化目标:已知莺尾花数据是4维的,共三类样本(150*4)。使用 РСA实现鸢尾花数据进行降维,实现在二维平面上的可视化。
PCA可以将具有相关性的高维变量合成为线性无关的低维变量,成为主成分,主成分能够尽可能的保留原始数据的信息
矩阵的主成分就是其协方差矩阵对应的特征向量,按照对应特征值大小排序,最大特征值为第一主成分,以此类推
- import matplotlib.pyplot as plt
- from sklearn.decomposition import PCA
- from sklearn.datasets import load_iris
-
- data=load_iris()
- y=data.target #使用y表示数据集中的标签
- x=data.data #使用x表示数据集中的属性数据
- pca=PCA(n_components=2) #加载PCA算法,设置降维后主成分数目为2
- reduced_X=pca.fit_transform(x) #对原始数据进行降维
- #下面按类别对降维后的数据进行保存
- red_x, red_y = [], [] #第一类数据点
- blue_x, blue_y = [], [] #第二类数据点
- green_x, green_y = [], [] #第三类数据点
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-
- for i in range(len(reduced_X)): #按照鸢尾花的类别将降维后的数据点保存在不同的列表中
- if y[i] == 0:
- red_x.append(reduced_X[i][0])
- red_y.append(reduced_X[i][1])
- elif y[i] == 1:
- blue_x.append(reduced_X[i][0])
- blue_y.append(reduced_X[i][1])
- else:
- green_x.append(reduced_X[i][0])
- green_y.append(reduced_X[i][1])
-
- plt.scatter(red_x, red_y, c='r', marker='x') #第一类数据点散点图
- plt.scatter(blue_x, blue_y, c='b', marker='D')
- plt.scatter(green_x, green_y, c='g', marker='.')
- plt.show()