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  • 关于AtomSeg程序移植问题(持续更新)


    Model作用 

    Model        Description
    circularMask  

    使用circularMask对原子柱分割

    circularMask_mse 使用均方误差的circularMask对原子柱进行分割
    gaussianMask使用高斯Mask高分辨率定位原子柱(高斯半高宽0.2埃的函数)
    deNoise图像去噪
    deNoise&bgremoval图像去噪+背景去除
    deNoise&bgremoval&supperes图像去噪+背景去除+超分辨率(强度保持)

    由于Gen1前缀的Model程序闪退,暂时找不到原因。

    源码参数解析

    如果需要移植的话,主要关注Code_Atom_Seg_Ui.py文件中__load_model函数

    参数解析图表

    Parameter      Description
    ori_image读入图像(TEM,SEM图)
    ori_content读入图像的Pillow格式
    output_image模型优化后的Pillow输出图像
    ori_markers保存时使用,rgb的原始图像以及探测原子后的结果
    out_markers

    保存时使用,rgb的去噪后的图像以及探测原子后的结果

    detect_result       探测结果图片
    model_output是由output_image的Pillow格式变换而来

    在__load_model函数中,函数末尾调用self.output_image.show(),可直接拿到输出文件(Line in 200)

    对于程序中,第二幅图片为preprocess,是由denoised_image进行三维(RGB)拼接的Pillow格式的图片。

    denoised_image:根据选择的(opening与erosion 图像处理的开运算(先膨胀后腐蚀)与腐蚀)对result进行处理后的图像

    程序的detect为显示探测结果,revert为清除当前所有图片运算。

    SAVE解析(没有特殊说明的文件 都为mat格式)

    model output保存output_image
    original image with markers保存ori_markers
    Four-panel image包含ori_content,output_image,ori_markers,out_markers四种
    Atom positions保存ori与output detect Model,与txt文件格式的原子坐标位置

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  • 原文地址:https://blog.csdn.net/qq_40620465/article/details/126224369
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