MySQL 的存储结构分为5级：表空间、段、簇、页、行。其存储逻辑如下：
- 连接层：负责连接处理、授权认证、安全方案，还可以实现 SSL 安全链接和线程池。
- 服务层：提供核心服务功能，如 SQL 接口、缓存查询、SQL 分析和优化、内置函数执行。服务器会解析查询并创建内部解析树，优化查询表顺序、索引利用等，生成执行操作。如果是 SELECT 语句，服务器还会查询内部缓存。
- 引擎层：通过 API 与存储引擎进行通信，负责数据存储和提取。不同存储引擎功能不同，可以根据实际需要进行选择。
- 存储层：将数据存储在文件系统上，完成与存储引擎的交互。
其中，InnoDB 存储引擎的逻辑存储结构分为表空间、段、簇、页、行。以段为例，一个ibd文件（独立表空间文件）会由很多个段组成，常见的段有数据段、索引段、回滚段等。段是一个逻辑的概念，创建一个索引会创建两个段：一个是索引段，管理非叶子节点的数据；一个是数据段，管理叶子节点的数据。