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  • pandas DataFrame内存优化技巧:让数据处理更高效


    合集 - pandas(35)
    1.【pandas基础】--数据读取2023-05-042.【pandas基础】--核心数据结构2023-05-073.【pandas基础】--数据检索2023-05-104.【pandas基础】--数据整理2023-05-145.【pandas基础】--数据修改2023-05-166.【pandas基础】--数据拆分与合并2023-05-187.【pandas基础】--数据排序2023-05-228.【pandas基础】--数据类型2023-05-279.【pandas基础】--日期处理2023-06-0210.【pandas基础】--索引和轴2023-06-0411.【pandas基础】--数据统计2023-06-0712.【pandas小技巧】--创建测试数据2023-07-1413.【pandas小技巧】--读取多个文件2023-07-1914.【pandas小技巧】--反转行列顺序2023-08-0215.【pandas小技巧】--修改列的名称2023-07-3116.【pandas小技巧】--按类型选择列2023-07-3017.【pandas小技巧】--随机挑选子集2023-07-2618.【pandas小技巧】--category类型补充2023-08-2119.【pandas小技巧】--统计值作为新列2023-08-1820.【pandas小技巧】--数据转置2023-08-1621.【pandas小技巧】--日期相关处理2023-08-1422.【pandas小技巧】--列值的映射2023-08-1023.【pandas小技巧】--字符串转数值2023-08-0924.【pandas小技巧】--缺失值的列2023-08-0725.【pandas小技巧】--拆分列2023-08-0326.【pandas小技巧】--花哨的DataFrame2023-08-2727.【pandas小技巧】--DataFrame的显示样式2023-08-2528.【pandas小技巧】--DataFrame的显示参数2023-08-2329.pandas高效读取大文件的探索之路01-2930.分组聚合不再难:Pandas groupby使用指南03-0531.别再低效筛选数据了!试试pandas query函数03-0432.掌握pandas cut函数,一键实现数据分类03-0633.pandas plot函数:数据可视化的快捷通道03-0834.Pandas导出美化技巧,让你的Excel更出众03-13
    35.pandas DataFrame内存优化技巧:让数据处理更高效03-14
    收起

    Pandas无疑是我们数据分析时一个不可或缺的工具,它以其强大的数据处理能力、灵活的数据结构以及易于上手的API赢得了广大数据分析师和机器学习工程师的喜爱。

    然而,随着数据量的不断增长,如何高效、合理地管理内存,确保Pandas DataFrame在运行时不会因内存不足而崩溃,成为我们每一个人必须面对的问题。

    在这个信息爆炸的时代,数据规模呈指数级增长,如何优化内存使用,不仅关乎到程序的稳定运行,更直接关系到数据处理的效率和准确性。通过本文,你将了解到一些实用的内存优化技巧,帮助你在处理大规模数据集时更加得心应手。

    1. 准备数据

    首先,准备一些包含各种数据类型的测试数据集。
    封装一个函数(fake_data),用来生成数据集,数据集中包含后面用到的几种字段。

    import pandas as pd
    import numpy as np
    
    def fake_data(size):
        """
        根据测试数据集:
        age:整数类型数值
        grade:有限个数的字符串
        qualified:是否合格
        ability:能力评估,浮点类型数值
        """
        df = pd.DataFrame()
        df["age"] = np.random.randint(1, 30, size)
        df["grade"] = np.random.choice(
            [
                "一年级",
                "二年级",
                "三年级",
                "四年级",
                "五年级",
                "六年级",
            ],
            size,
        )
        df["qualified"] = np.random.choice(["合格", "不合格"], size)
        df["ability"] = np.random.uniform(0, 1, size)
    
        return df
    

    2. 检测内存占用

    使用上面封装的函数(fake_data)先构造一个包含一百万条数据的DataFrame。

    df = fake_data(1_000_000)
    df.head()
    

    image.png

    看看优化前的内存占用情况:

    df.info()
    

    image.png
    内存占用大约 26.7MB 左右。

    3. 优化内存

    接下来,我们开始一步步优化DataFrame的内存占用,
    并测试每一步优化之后的内存使用情况和运行性能变化。

    3.1. 优化整型数据

    首先,优化整型数据的内存占用,也就是测试数据中的年龄(age)字段。
    从上面df.info()的结果中,我们可以看出,age的类型是int32(也就是用32位,8个字节来存储整数)。
    对于年龄来说,用不到这么大的整数,用int8(数值范围:-128~127)来存储绰绰有余。

    df["age"] = df["age"].astype("int8")
    df.info()
    

    image.png
    优化之后,内存占用从26.7+ MB减到23.8+ MB。

    3.2. 优化浮点型数据

    接下来优化浮点类型数据,也就是测试数据中的能力评估值(ability)。
    测试数据中ability的值是6位小数,类型是float64,
    转换成float16可能会改变值,所以这里转换成float32。

    df["ability"] = df["ability"].astype("float32")
    df.info()
    

    image.png
    优化之后,内存占用进一步从23.8+ MB减到20.0+ MB。

    3.3. 优化布尔型数据

    接下来,优化测试数据中的是否合格(qualified),
    这个值虽然是字符串类型,但是它的值只有两种(合格和不合格),所以可以转换成布尔类型。

    df["qualified"] = df["qualified"].map({"合格": True, "不合格": False})
    df.info()
    

    image.png
    优化之后,内存占用进一步从20.0+ MB减到13.4+ MB。

    3.4. 使用category类型

    最后,我们再优化剩下的字段--年级(grade)。

    这个字段也是字符串,不过它的值只有6个,虽然无法转换成布尔类型(布尔类型只有两种值True和False),但是它可以转换为pandas中的 category 类型。

    df["grade"] = df["grade"].astype("category")
    df.info()
    

    image.png
    优化之后,内存占用进一步从13.4+ MB减到6.7+ MB。

    4. 总结

    各类字段优化之后,内存占用从刚开始的26.7+ MB减到6.7+ MB,优化的效果非常明显。

    仅仅是数据类型的简单调整,就带来了如此之大的内存效率提升,
    这也给我们带来启示,在数据分析的过程中,构造DataFrame时,也可以根据数值的范围,特点等,
    来赋予它合适的类型,不要一味简单的使用字符串,或者默认的整数(int32),默认的浮点(float64)等类型。

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  • 原文地址:https://www.cnblogs.com/wang_yb/p/18072655
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