Bootloader是所有支持重编程的ECU必须具备的软件功能，在ECU运行过程中，执行的是应用软件和应用数据，仅当应用软件或应用数据无效或者上电之初，或者要求对其进行升级或特殊测试的时侯，才会运行Bootloader软件。
应用软件和应用数据、标定数据、网络配置数据可以同时编程或者相互独立编程，通常在ECU在刷入bootloader后，bootloader是无法再次更新的，除非拆件，不过现在这越来越多的主机厂要求Bootloader也要支持刷写。Bootloader存储于被保护的flash区域，即使发生潜在错误时，控制器的应用软件始终可以刷新。
在每次上电/复位后，ECU首先执行Bootloader代码。Bootloader首先执行一些基本的初始化，然后检查刷新请求标志位是否为有效，如果刷新请求标志位有效，即使应用程序是有效的，Bootloader也会继续运行。如果当前没有刷新请求，即刷新请求标志位为无效，则检查应用软件的状态，如果应用软件是有效的，则应用软件代码将被执行，如果应用软件是无效的，则继续执行Bootloader代码，如下图所示。