• Java实现Fisher‘s Exact Test 的置信区间的计算


    实现代码
    package com.bgi.aigi.common.utils;
    
    public class FisherExactUtils {
    	
    	public static double[]  getConfidenceInterval(double[][] data) {
    		if (data==null||data.length!=2||data[0].length!=2||data[1].length!=2) {
    			return null;
    		}
    		double[] interval=new double[2];
    		double a=data[0][0];
    		double b=data[0][1];
    		double c=data[1][0];
    		double d=data[1][1];
    		double r= (a / c) / (b / d);
    		double cinit = Math.sqrt((1 / a) + (1 / b) + (1 / c) + (1 / d));
    		double y = Math.log(r) - (1.96 * cinit);
    		double z = Math.log(r) + (1.96 * cinit);
    		y = Math.exp(y);
    		z = Math.exp(z);
    		y = Math.round(y * 10000d) / 10000d;
    		z = Math.round(z * 10000d) / 10000d;
    		interval[0]=y;
    		interval[1]=z;
    		return interval;
    	}
    	public static double  getOddsRatio(double[][] data) {
    		if (data==null||data.length!=2||data[0].length!=2||data[1].length!=2) {
    			return Double.NaN;
    		}
    		double a=data[0][0];
    		double b=data[0][1];
    		double c=data[1][0];
    		double d=data[1][1];
    		return (a / c) / (b / d);
    	}
    	public static void main(String[] args) {
    		double[][] data= {{4,20},{1,80}};
    		System.out.println("下限:"+getConfidenceInterval(data)[0]);
    		System.out.println("上限:"+getConfidenceInterval(data)[1]);
    		System.out.println(getOddsRatio(data));
    	}
    }
    
    
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    说明

    这段算法是从一个网站(https://www.easycalculation.com/statistics/odds-ratio.php)源码中发现,仅仅是php转换成了java。
    我没有找到具体的公式说明,包括计算fisher exact的置信区间公式是什么,为什么这样计算等等,有知道的朋友也欢迎指出,提前感谢。

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  • 原文地址:https://blog.csdn.net/miaoyibo12/article/details/134022160