码农知识堂 - 1000bd
  •   Python
  •   PHP
  •   JS/TS
  •   JAVA
  •   C/C++
  •   C#
  •   GO
  •   Kotlin
  •   Swift
  • conda常用命令


    刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

    linux系统上下载并安装conda:

    wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

    bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

    后续具体步骤参照  ——-生信技能树conda管理生信软件一文就够

    查看是否成功安装

    source ~/.bashrc

    未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

    conda --help

    若出现“conda command not found”这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

    vim ~/.bashrc

    在~/.bashrc文件结尾加上

    export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

    退出后,再次执行

    source ~/.bashrc

    conda --help

    配置conda镜像

    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

    conda config --set show_channel_urls yes

    source ~/.condarc

    通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

    创建小环境

    conda create -n +创建环境名称

    查看小环境

    conda info -e

    进入小环境

    source activate  +环境名称

    查看小环境已安装的软件

    conda list

    安装相应版本的软件

    conda install PACKAGENAME==VERSION

    查找相应的软件包

    conda search PACKAGENAME

    退出小环境

    conda deactivate

    移除小环境

    conda env remove --name bio-env



    作者:阿糖胞苷_SYSU
    链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1
    来源:简书
    著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

     

    conda常用命令 - 简书

  • 相关阅读:
    Ant Design Vue UI框架的基础使用,及通用后台管理模板的小demo【简单】
    js 实现月份的切换,初始化当前月,前进到前一个月份,后退到后一个月份。
    UnityPackageManager相关
    PHP框架详解 - symfony框架
    基于kubernetes平台微服务的部署
    【React源码】(十七)React 算法之深度优先遍历
    亚马逊、temu流量暴涨,单量却不动?自养号测评的优势和弊端详解
    《C++避坑神器·二十六》结构体报重定义错误问题和std::variant同时存储不同类型的值使用方式
    小白学Java
    7.(vue3.x+vite)组件间通信方式之vuex
  • 原文地址:https://blog.csdn.net/sinat_30603081/article/details/133026569
  • 最新文章
  • 攻防演习之三天拿下官网站群
    数据安全治理学习——前期安全规划和安全管理体系建设
    企业安全 | 企业内一次钓鱼演练准备过程
    内网渗透测试 | Kerberos协议及其部分攻击手法
    0day的产生 | 不懂代码的"代码审计"
    安装scrcpy-client模块av模块异常,环境问题解决方案
    leetcode hot100【LeetCode 279. 完全平方数】java实现
    OpenWrt下安装Mosquitto
    AnatoMask论文汇总
    【AI日记】24.11.01 LangChain、openai api和github copilot
  • 热门文章
  • 十款代码表白小特效 一个比一个浪漫 赶紧收藏起来吧!!!
    奉劝各位学弟学妹们,该打造你的技术影响力了!
    五年了,我在 CSDN 的两个一百万。
    Java俄罗斯方块,老程序员花了一个周末,连接中学年代!
    面试官都震惊,你这网络基础可以啊!
    你真的会用百度吗?我不信 — 那些不为人知的搜索引擎语法
    心情不好的时候,用 Python 画棵樱花树送给自己吧
    通宵一晚做出来的一款类似CS的第一人称射击游戏Demo!原来做游戏也不是很难,连憨憨学妹都学会了!
    13 万字 C 语言从入门到精通保姆级教程2021 年版
    10行代码集2000张美女图,Python爬虫120例,再上征途
Copyright © 2022 侵权请联系2656653265@qq.com    京ICP备2022015340号-1
正则表达式工具 cron表达式工具 密码生成工具

京公网安备 11010502049817号