deepvariant 基因变异识别算法docker版使用

参考：https://github.com/google/deepvariant

docker版安装

参考：https://github.com/google/deepvariant/blob/r1.4/docs/deepvariant-quick-start.md
本文是windows上安装的deepvariant 1.4.0版本

docker pull google/deepvariant:1.4.0
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docker版使用

案例参考：https://github.com/google/deepvariant/blob/r1.4/docs/deepvariant-quick-start.md

1）下载案例fasta、bam数据
https://storage.googleapis.com/deepvariant/quickstart-testdata/ucsc.hg19.chr20.unittest.fasta.fai
这里下载了如下四条数据

2）创建本地文件夹方便后续挂载到容器对应目录
创建了 deepvariant文件夹，下面放了input_dir、output_dir；然后把上面下载的4条数据放到deepvariant\input_dir\quicks