蛋白质结构预测 AlphaFold2、ColabFold、Uni-Fold

AlphaFold2：官方地址 https://github.com/deepmind/alphafold

ColabFold：高效封装加速AlphaFold2及 Alphafold2-multimer（四级结构，多条氨基酸预测）
https://github.com/sokrypton/ColabFold

Uni-Fold：深势科技参考AlphaFold2推出版本
https://github.com/dptech-corp/Uni-Fold

下面案例用的是同样的氨基酸序列来预测，两条分别是

PIAQIHILEGRSDEQKETLIREVSEAISRSLDAPLTSVRVIITEMAKGHFGIGGELASK


LILNLRGGAFVSNTQITMADKQKKFINEIQEGDLVRSYSITDETFQQNAVTSIVKHEADQLCQINFGKQHVVCTVNHRFYDPESKLWKSVCPHPGSGISFLKKYDYLLSEEGEKLQITEIKTFTTKQPVFIYHIQVENNHNFFANGVLAHAMQVSI
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4

1、ColabFold （用google colab运行测试）

参考：

https://colab.research.google.com/github/sokrypton/ColabFold/blob/main/AlphaFold2.ipynb#scrollTo=G4yBrceuFbf3

使用两条氨基酸序列预测结构，多条用࿱