使用docker获取docker hub中的项目并复现

1. 安装docker

如果在windows上安装的话，那原先在电脑上的vmware就不能使用了，因此本人这里选择在vmware的ubuntu 18.04虚拟机上安装docker，若事先没有安装vmware的话，可以选择在windows上安装。

ubuntu安装docker代码

sudo apt-get update
sudo apt-get install -y docker.io
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检测docker是否安装成功

docker version
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这里可能会有因为用户权限出问题，可以这样解决点击这里。
安装成功就会下面的图片

2. 获取pnet项目文件

拉取pnet项目镜像

docker pull yinssiy/pnet
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拉取后使用下面的命令看看刚刚获取的镜像是否在docker里面了

docker image ls
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用pnet 镜像生成容器（pnet_test是要生成的容器名，你可以换成自己的名字，yisnsiy/pnet是所要用的镜像名）

sudo docker run --name pnet_test -idt yisnsiy/pnet
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看下创建的容器是否成功

docker ps -a
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启动名为pnet_test的容器

docker start pnet_test
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进入pnet_test容器

docker exec -it pnet_test /bin/bash
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这样就进入装有anaconda和pnet新的系统

3. 运行pnet项目

切换到运行pnet所需的名为pnet_env的虚拟环境

conda activate pnet_env
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进入pnet项目的目录

cd /home/code/pnet_prostate_paper
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环境和依赖都已经配好了，使用github上的命令运行项目即可

因为docker中系统支持图形化界面比较麻烦，需要对docker的宿主机进行过多操作，而且生成图片的中间数据在此项目中都有，图片也可以在项目所属的github中查看。所以这个项目中不支持查看图片，若有兴趣弄出图形化可以自行捣鼓，此贴为自己捣鼓docker的学习过程的记录。
参考博客
（本人自用）将本地的anaconda环境封装到docker中并导出为压缩包